EmFTP Professional podporuje SFTP přes SSH (Secure Shell). Tradiční FTP posílá heslo a obsah souboru bez šifrování, tím dochází k potenciální nebezpečí, že heslo a obsah souboru bude možné zneužít. SFTP šifruje hesla a obsah souboru, takže je to bezpečnější. Quick Connect Bar (EmFTP Professional) umožňuje připojení k serveru pouze zadáním adresy URL. Quick Connect Bar lze přepínat mezi základním režimem a režimem s detaily uživatelského jména, hesla a další. Filtr Feature (EmFTP Professional) umožňuje přenášet pouze soubory určitého typu. Filtr může být upřesněny v Filtr Bar v příkaze Panely nástrojů. Například se uvede "*. htm" převod pouze soubory s příponou htm. Pomocí této funkce můžete zobrazit nebo převést pouze potřebné soubory. Uživatelské rozhraní je podobné jako design pro systém Windows XP.